大明永歷元年八月（西歷1647年，清順治四年），等朱由榔君臣籌到救急的糧餉后不久，天下的局勢對大明已是非常不利了。
由于四川督師王應熊意外病故，川南一地的大小軍閥割據自雄。四川因為距離明廷中樞太遠，又長期處于抗清前線，朝廷鞭長莫及，武將大多軍閥化了，而四川督師王應熊又意外病死，沒了文臣大吏制約，大小軍閥根本不聽朝廷的號令，朝廷對四川幾乎失去了控制。
在這種局面下。必須再任命一位德才兼備的四川督師以收拾殘局，朱由榔考慮再三，決定起用賦閑在鄉的文安之擔任四川督師。
文安之，天啟二年進士，曾任南京司業、祭酒。后為權臣薛國觀彈劾，罷官家居。南明福王起為詹事，唐王召為禮部尚書，都因交通不便，未就職。
朱由榔起用文安之，靠的就是預知歷史的前瞻性，在真實的歷史上，文安之在永歷三年奔赴行在，為聯絡川中諸鎮之兵，自請擔任四川督師，走到到貴州都勻時，為孫可望所拘。數月后脫身到川東，聯絡川鄂邊境的義軍——夔東十三家抗清。獨撐危局。一直堅持到1659年，政治能力很強。
其資歷和能力都足夠擔任封疆大吏。而且其在湖北三峽，由湖北入四川也也比較方便。
云南的情況也比較糟糕。
由于土司沙定洲作亂。云貴總督和云南巡撫都當了沙定洲的俘虜，沙定洲占領昆明以后，自稱“總府”，“總府”是明黔國公世爵的一般稱呼。其妻萬氏稱主母。“并輿出入，遍謁縉紳。滇中豪右投為謀劃者甚眾”。沙定洲派兵追拿沐天波，在楚雄被楊畏知集結的軍隊擊敗。他在西進失利之后，發兵收取云南各地，在不長時間里除了楊畏知、沐天波控制下的楚雄以西地區外，都歸附了沙氏。
沙定洲輕而易舉地攫得了沐府累世蓄積的財富。“沐氏世鎮云南，府藏盈積。佛頂石、青箭頭、丹砂、落紅、琥珀、馬蹄、赤金皆裝以篋，篋皆百斤，藏以高板，板庫五十篋，共二百五十余庫，他珍寶不可勝計。定洲運入本峒，累月不絕”。他因此發了一大筆橫財。
云南距離廣東太遠，千里迢迢，道路崎嶇，朱由榔也沒有太好的辦法，只能盡力補救，他詔令云南副使楊畏知出任云貴總督，協調各地土司剿滅沙定洲。
在云南這個地方，黔國公沐天波的地位無可替代，大小土司都只認黔國公的世襲鐵券，沙定洲雖然占領了昆明，但是沐天波帶著世襲鐵券和官印孤身逃走，其他的土司都不服沙定洲。
沙定洲為了維持自己的統治，就脅迫控制云貴總督和云南巡撫，用他們的官印發布各種命令，昆明的朝廷官府成了沙定洲的工具，如果重新任命一個云貴總督，否定昆明官府的合法性，沙定洲就玩不轉了。
楊畏知是云南的地方官，駐節楚雄，沙定洲造反之后，沐天波逃到了永昌府，楊畏知獨守楚雄，抵抗沙定洲，雙方已經僵持了好幾個月，由他擔任云貴總督，可以領導其他土司對抗沙定洲。
不過此時的貴州已被張獻忠的余部占領，獻部與闖部終究不同，李自成死后，闖部分崩離析，如今已經被明清兩家瓜分，但是張獻忠死后，張可望、李定國、劉文秀等人竟能團結一心，共謀進退，依舊是一支強勁的力量，他們乘明軍與清軍拼殺之際，由川入黔，一路攻克遵義、貴陽，奪取了貴州。
如果局部的歷史沒有改變的話，再過幾個月，孫可望就會在沐天波的引導下，攻入云南，剿滅沙定州，最后逐步蠶食云、貴、川等地，依靠天然屏障，在西南整軍備武，積蓄力量。
現在誰也不知，對于大明和清軍，獻忠余部是什么態度，如果依然打著反明的旗幟，那么兩廣便會陷入左右交困之中，天下局勢便難以逆料了。
好在近幾月來自廣州的壓力并不大，李成棟兩次西征無功而返，不僅損兵折將，實力大損，還被清廷攝政王多爾袞狠狠批了一頓，責令其整軍備武，早日擒殺永歷，戴罪立功。
李成棟心里憋著一肚子火，卻無處發泄。
此前擒殺兩位明皇，他自以為功勛卓著，兩廣總督一職非己莫屬。不料論功行賞之際，清廷重用“遼人”，竟讓沒有多少資歷，也沒有多大戰功的佟養甲做了廣東巡撫兼兩廣總督。而他只落了個廣東提督的職位，不僅無權過問地方政務，而且在軍事行動上還要接受佟養甲的調度和節制，兩人原先的同僚地位變成了上下級關系。
清廷重用“遼人”而作出的不公平的對待，對于野心勃勃的李成棟來說本就難以接受，現在因為戰事失利還要天天看佟養甲的臉色，李成棟的內心已是十分不滿，有幾次，他一直盯著佟養甲的頭看，直到把佟養甲看得心頭發毛才哈哈一笑，告辭而去。
也許是預料到李成棟難以完成使命，又想盡快平定南方，早在永歷元年八月初的時候，多爾袞就已經明令恭順王孔有德、懷順王耿仲明、智順王尚可喜，續順公沈志祥、右翼固山額真金礪率本部兵馬南下平定，以孔有德為平南大將軍節制諸部。一路打湖廣，一路經浙江、福建，入廣東。東西夾擊，力爭一舉擒殺永歷，消滅明廷。
這一次孔有德等三順王一順公的漢軍旗幾乎傾巢而出，部下的戰、輔兵共計四萬七千余人，另有金礪率一萬五千名漢軍旗助戰。
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